Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pmfbp1Q9WVQ0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pmfbp1Q9WVQ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms