Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clcn5Q9WVD4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms