Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stxbp4Q9WV89 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stxbp4Q9WV89 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stxbp4Q9WV89 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stxbp4Q9WV89 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stxbp4Q9WV89 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Stxbp4Q9WV89 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Stxbp4Q9WV89 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stxbp4Q9WV89 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stxbp4Q9WV89 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stxbp4Q9WV89 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stxbp4Q9WV89 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stxbp4Q9WV89 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stxbp4Q9WV89 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stxbp4Q9WV89 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stxbp4Q9WV89 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Stxbp4Q9WV89 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms