Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mixl1Q9WUI0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mixl1Q9WUI0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms