Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Stub1Q9WUD1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms