Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdh13Q9WTR5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdh13Q9WTR5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdh13Q9WTR5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdh13Q9WTR5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdh13Q9WTR5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdh13Q9WTR5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdh13Q9WTR5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdh13Q9WTR5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdh13Q9WTR5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh13Q9WTR5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms