Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6cQ9WTM3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms