Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms