Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Htra1Q9R118 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Htra1Q9R118 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms