Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Plod1Q9R0E2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Plod1Q9R0E2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms