Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clcf1Q9QZM3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clcf1Q9QZM3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms