Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc3Q9QZC1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Trpc3Q9QZC1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Trpc3Q9QZC1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Trpc3Q9QZC1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Trpc3Q9QZC1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Trpc3Q9QZC1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Trpc3Q9QZC1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Trpc3Q9QZC1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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Trpc3Q9QZC1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trpc3Q9QZC1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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