Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Exo1Q9QZ11 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Exo1Q9QZ11 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms