Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bcl11aQ9QYE3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bcl11aQ9QYE3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms