Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Opn4Q9QXZ9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Opn4Q9QXZ9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms