Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ChmQ9QXG2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms