Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trp53inp1Q9QXE4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms