Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cul3Q9JLV5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cul3Q9JLV5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms