Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Higd1aQ9JLR9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Higd1aQ9JLR9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Higd1aQ9JLR9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Higd1aQ9JLR9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Higd1aQ9JLR9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Higd1aQ9JLR9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Higd1aQ9JLR9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Higd1aQ9JLR9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Higd1aQ9JLR9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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