Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms