Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfr2Q9JKX3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tfr2Q9JKX3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tfr2Q9JKX3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Tfr2Q9JKX3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tfr2Q9JKX3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tfr2Q9JKX3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms