Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap4m1Q9JKC7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms