Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssna1Q9JJ94 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssna1Q9JJ94 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms