Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc12a4Q9JIS8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc12a4Q9JIS8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc12a4Q9JIS8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc12a4Q9JIS8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc12a4Q9JIS8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc12a4Q9JIS8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc12a4Q9JIS8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc12a4Q9JIS8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc12a4Q9JIS8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc12a4Q9JIS8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms