Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl1Q9JI74 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl1Q9JI74 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms