Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rapgef4Q9EQZ6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef4Q9EQZ6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms