Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r47Q9EQ51 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r47Q9EQ51 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms