Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r44Q9EQ47 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r44Q9EQ47 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms