Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf21Q9EPU5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms