Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms