Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp1bQ9EPL6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp1bQ9EPL6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms