Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aph1cQ9DCZ9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Aph1cQ9DCZ9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Aph1cQ9DCZ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms