Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Eif3fQ9DCH4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms