Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tomm20Q9DCC8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tomm20Q9DCC8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms