Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk1dQ9DC28 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csnk1dQ9DC28 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms