Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxp4Q9DBY0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxp4Q9DBY0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms