Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Swt1Q9DBQ9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms