Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc54Q9DAL3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc54Q9DAL3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms