Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Samd8Q9DA37 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms