Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms