Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms