Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rexo2Q9D8S4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rexo2Q9D8S4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms