Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Arfgap3Q9D8S3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Arfgap3Q9D8S3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms