Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp4bQ9D8B3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chmp4bQ9D8B3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp4bQ9D8B3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms