Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmigd1Q9D7L8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmigd1Q9D7L8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms