Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabra4Q9D6F4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabra4Q9D6F4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms