Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ShpkQ9D5J6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ShpkQ9D5J6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms