Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fsip1Q9D3V5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fsip1Q9D3V5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fsip1Q9D3V5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fsip1Q9D3V5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fsip1Q9D3V5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fsip1Q9D3V5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms