Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Fndc8Q9D2H8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Fndc8Q9D2H8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Fndc8Q9D2H8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Fndc8Q9D2H8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Fndc8Q9D2H8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Fndc8Q9D2H8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Fndc8Q9D2H8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Fndc8Q9D2H8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Fndc8Q9D2H8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Fndc8Q9D2H8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Fndc8Q9D2H8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc8Q9D2H8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms