Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Creb3l4Q9D2A5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms